Родился в городе Тулун Иркутской области.
Среднее образование получил в городской школе.
В 1939 г. поступил в Томский политехнический институт на специальность «Двигатели внутреннего сгорания».
В 1940 г. по окончании первого курса, призван в Красную Армию. Участвует боевых действиях Великой Отечественной войны 1941-1945 гг.
В 1946 г. после демобилизации, продолжил учёбу в Томском политехническом институте, который окончил в 1950 г. с отличием и поступил в аспирантуру.
В 1954 г. защитил кандидатскую диссертацию, по теории автоматического регулирования двигателей, и направлен на работу в Таганрогский радиотехнический институт — преподаватель, старший преподаватель, доцент, декан факультета автоматики и вычислительной техники.
С 1962 г. — проректор по учебной работе Таганрогского радиотехнического института.
В 1971-1986 гг. — ректор Курского политехнического института (КПИ).
Под руководством Е.В. Ковалёнка в КПИ открылись новые специальности: «Обогащение полезных ископаемых», «Технология и комплексная механизация открытой разработки месторождений полезных ископаемых», «Химическая технология и оборудование отделочного производства», «Трикотажное производство», «Электронно-вычислительные машины», «Конструирование и производство электронно-вычислительной аппаратуры», «Электроснабжение промышленных предприятий, городов и сельского хозяйства», «Промышленное и гражданское строительство», «Сельскохозяйственное строительство», «Теплогазоснабжение и вентиляция», «Водоснабжение и канализация».
Введены в эксплуатацию: главный учебный корпус (ул. 50 лет Октября), спорткомплекс, три студенческих общежития, столовая, овощехранилище, гаражи, склады и др. хозяйственные постройки.
Сфера научных интересов: расчёты на прочность деталей машин и элементов тепловых агрегатов при динамических нагрузках и при изменении температуры.
Е.В. Ковалёнок — автор 3-х изобретений и более 30 научных работ и статей по вопросам методики обучения и управления вузом.
Е.В. Ковалёнок вёл большую общественную работу.
В 1972 г. избран председателем областного Совета и членом пленума Всесоюзного Совета научно-технических обществ.
В 1977-1986 гг. исполнял обязанности председателя Совета ректоров города Курска. Деятельность Совета заслужила большой авторитет и признание вузовской общественности.
За успешную работу по руководству вузом Министерство высшего и среднего специального образования РСФСР отметило работу Е.В. Ковалёнка знаками «Победитель соцсоревнования» (1973,1974,1975 годы) и «Ударник пятилетки».
Награды: орден Отечественной войны 2 степени, медаль «За отвагу» и др., «орден Знак Почёта»